До середины XVIII в. напротив соборной мечети находилось большое медресе, также носившие имя Биби-ханым. Пер­воначально портал медресе был настолько крупным, что соперничал с порталом соборной мечети. Это разгне­вало Амира Темура и тот приказал его перестроить. Медресе было разрушено при вторжении Надиршаха. На цент­ральной оси медресе находится мавзо­лей, ставший усыпальницей матери Сарай-Мульк-ханым и еще двух женщин ее рода. Это высокое восьмигранное сооружение с цилиндрическим бараба­ном, опоясанным крупной куфической надписью. Интерьер украшен мозаич­ной панелью и росписями, где наряду с орнаментальными мотивами использу­ются пейзажи райского сада.