Постройка медресе Ходжамберды-бия у восточных ворот Ичан-Калы датируется 1688 г. При строительстве медресе Алла-Кули-хана это медресе было кардинально перестроено. Из-за сильной разницы уровней оно стало как бы основанием монументальной платформы медресе Алла-Кули-хана. Пандусный подъем рассек медресе Ходжамерды-бия пополам. Отсюда его новое название — медресе Хурджум («переметная сумка»). Из-за тесноты участка строительство медресе Алла-Кули-хана потребовало разрушения части городской стены. Южным крылом новое медресе надвинулось на лавки северного торгового ряда Палван- Дарваза, северным — примкнуло к сводам тима Алла-Кули-хана.