Исламский институт Имама аль-Бухари был основан в 1971 году выдающимся исламским религиозным деятелем, проповедником и ученым шейхом Зийуддинханом ибн Эшоном Бабаханом. Несмотря на трудности, ему удалось добиться открытия первого в Институте СССР, где изучался ислам. Здание института было построено на месте мечети Намазгох (конец XIX века), разрушенной в годы революция, как и большинство религиозных памятников. После того, как было решено открыть здесь исламский институт, здание было восстановлено. И нынешний образ Исламского института был в 1997 году после очередной крупной реконструкции комплекса Хаст-Имам, на территории которого он находится. Сегодня Ташкентский исламский институт ежегодно обучает до 200 студентов: мальчиков и девочек, которые затем работают не только в религиозных учреждениях, но и в светском. Образовательная программа института координируется с Комитетом по делам религий и Министерством высшего образования. После окончания университета выпускники получают дипломы государственного мастера. В этом высшем мусульманском институте прошли обучение многие известные богословы, муфтия и улема СНГ, такие как: Равиль Гайнутдин, Ахмад Кадыров, Умар Идрисов, Аллахшукюр Пашазаде и другие.